Центральную роль в формировании природоохранного мышления играет Музей природы. Он является базой активной эколого-просветительской работы с населением и посетителями заповедника и создает благоприятный психологический климат для деятельности заповедника. Музей функционирует с 1937 г., расположен в деревянном здании постройки 1890 г., занимает 2 комнаты, площадью 128 кв. м., имеет170 единиц хранения.

Основателем музея был Красовский В.П. Большой вклад в формирование экспозиций, и витрин внесли сотрудники и таксидермисты Анохин В.А., Коньков В.П., Рябов Л.С. и Печенюк А.Д. Ежегодно музей посещают более 2 тысяч человек. География посетителей обширна - это жители Новохоперского района и Воронежской области; экскурсанты из Москвы, С.-Петербурга, Челябинска, Мурманска, Владивостока, Читы, Иркутска, Киева и др. городов России.

В последнее время организованы передвижные фотовыставки, демонстрирующие красоту и богатство заповедной природы. Впервые они были представлены в 2003 г. в г. Новохоперске. Выставки экспонировались в Волгограде, Воронеже, Борисоглебске размещались в краеведческих музеях, библиотеках, университетах, школах, в городских ДК, других заповедниках. Фотовыставки всегда вызывают большой интерес.